贝克的母亲丽齐的抑郁症显然延宕了好几年。贝克的父亲和哥哥告诉他，母亲丽齐的抑郁症因为年纪最小的他于1921年6月18日出生而得到了缓解。贝克相信在他母亲心目中，他是母亲早逝的女儿碧翠斯的代替品，母亲有点失望他不是女孩子，只是他从来没有听她这么说过，但是在积极的一面而言，他却很喜欢自己那么小就能够治疗母亲的抑郁症。他开玩笑说，这说明了他有必要控制一切状况！
丽齐因为已经失去两个孩子，所以非常保护最小的孩子阿伦。贝克七岁时发生一次意外差点死掉，使她保护他更加心切。贝克的哥哥毛瑞斯还记得这一次意外，那是他和贝克一起到家附近的运动场玩，贝克“显然正在一个斜坡上方，有人推了他一下，他跌倒，摔断了手骨。后来他受到感染，陷入病危状态。我还记得自己在病房看到他躺在床上，手臂打上石膏，伸得直直的样子。”
毛瑞斯那时侯不知道阿伦病情有多严重，因为大人不让他知道。贝克的病情是手臂折断，然后又受到感染，先是骨髓炎，然后变成血液感染细菌的败血病。哥哥艾文后来告诉贝克，当时败血症无药可医，所以他百分之九十可能会死。艾文偷听到医生告诉丽齐阿伦可能会死，他母亲马上回答说：“他不会死！我儿子不会死！”艾文说：“她很坚定！”贝克记得很清楚自己生了病，但是不知道病到差一点死掉。他说“我在医院过八岁生日。我还记得那一天母亲很高兴，因为我已经脱离病危期”。他的病危期足足有两个月。这一段期间丽齐极为紧张忧虑，常常跑去看电影。她过度保护阿伦并没有使阿伦减少自主独立，可是他说：“很自主独立并没有使我不害怕生病。 ”
他生病的后果主要表现在焦虑、恐慌和逃学上面，逃学反过来又使他认为自己很无能、愚笨。另外，一年级那年他的老师很苛刻，有一次因为他把天空“画错颜色”（他涂上蓝色）而对他吼叫。 这虽然事出偶然，却让他觉得自己很愚蠢。他说：“我很难过，这或许已经造成很强烈的图式 (schema)，因为我从来没有忘记。我一年级留级，我常常觉得那是因为我很笨的关系。多年以后我问母亲这件享，她说那时候我经常生病。这表示我比同学落后，他们都已经升到不同年级，表示我天生就不如人，改变不了了。我不喜欢比朋友落后。到了三年级我已经超前（半年），可以跳级，于是我跟母亲说，她便跟老师说。”
贝克借着自助方式最后比同学超前一年。在他而言，“心理上这证明我能够做事；如果我掉进洞里，我可以自己爬出来。我可以自己来，这种经验对我影响很大。我给人家比下去了，心理上，‘我曾被击倒’这种想法会让我动起来。‘绝对不说死’，这种态度是一种挑战，把不利之处变成了有利之处。”
他努力克服自己很笨、很无能的想法，相反的证据使他更加努力。他在课业上一直超前。哥哥毛瑞斯有时侯很欣赏他弟弟的成功，他看到贝克的成绩单，发现他的成绩比艾文还要好，感到非常高兴。
在贝克的童年记忆中，他的父母彼此气质差别很大。父亲个性宁静，母亲个性活泼。贝克说她知识丰富，总是鼓励大家往前迈进，譬如决定跳级。然而，“她并不是完美的母亲，常常前后矛盾。如果她心情不好就大吼大叫，这真令人苦恼。我不知道这有没有影响我的人格，但是却造成了我的敏感。我没有办法解释。有时侯她会很没有理性，动不动就掉眼泪。几个礼拜没事，接着又开始了。我搞不懂，只好认为她太容易激动。我 —直不喜欢。”贝克认为，由于他和母亲的这种经验，还有一年级老师那次突如其来的怒责，使他至今仍然对别人的情绪变得很敏感。
父亲培养了贝克对科学和自然的兴趣。贝克参加奥都邦学会，参与赏鸟和植物观察活动。他也参加童子军，十五岁就成为最年轻的鹰级童子军。贝克就读希望中学 (Hope High School)的时侯，担任校刊编辑，并且负责一个专栏，还写诗。－个同学顺着特姆金这个姓氏，昵称他提姆 (Tim)。特姆金与贝克家族没有人叫他提姆，不过后来他太太和同事都叫他提姆。
他的生涯兴趣经常变化，不过他“真正想做的是谋生”。贝克家并不穷，可是生活却很节俭。哈瑞·贝克开店，自己做账。他们家从来没有买过汽车，三个儿子都是靠打工念完大学。贝克以第一名成绩毕业于希望中学，跟他两个哥哥一样，都上布朗大学。艾文成为内科医生，毛瑞斯获得心理学学士及硕士学位，后来做社会工作。贝克就读布朗大学时是校刊《布朗前锋日报》的总编辑。他的奖学金支付了他的部分开销，其他费用他就以送报纸、在图书馆打工、协助一名都市规划师测量普罗维登斯、挨家挨户推销福乐牙刷等工作，来赚钱支付。他卖福乐牙刷一直到就读耶鲁医学院的第一学期为止。
贝克在布朗大学主修英文和政冶学，又选修艺术、音乐、会计，再加上其他学科——事实上是除了工程，全部都选修。他的好奇心和控制欲主宰了他的选择。因为不确定自己的职业生涯方向，所以他曾经寻求职业生涯咨询老师的辅导。经过测验以后，老师建议他当青年会 (YMCA)咨询师。这一项建议其实并不适合他，因为他对有机化学也很好奇，所以就开始打听医学职业的事情。那时候，因为有限制犹太人的限量制度，所以一位系主任建议他不要申请医学院，否则医学院会挤满够资格的犹太人，可是贝克还是选修了医学院先修课程，毕业以后还继续上课，以完成申请医学院的必修课。
1942他当选荣誉学会会员，并以优等成绩从布朗大学毕业。荣誉学会是表彰人文学科成绩优秀学生的组织，他在毕业典礼中获得辩论奖和写作奖。他只具备最低的医学院入学资格，只有三项或四项符合，因此他认为自己能够进耶鲁医学院就读，应该归功于奥尔德斯·赫胥黎教授。他由一位儿科教授做入学口试，这位教授问他曾经看过什么书，他回答说他读过赫胥黎所有已出版的著作，结果才发现这位教授竟然也是赫胥黎迷。
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